Dem Amt für Justizvollzug obliegt der Straf- Massanhmenvollzug und die Durchführung der verschiedenen Haftarten.

Dem Amt kommt dabei eine Doppelfunktion zu:

Als Vollzugsbehörde sind die Bewährungs- und Vollzugsdienste für die Durchführung der verschiedenen Sanktionen verantwortlich und weisen diese in die entsprechenden – auch ausserkantonalen – Vollzugsinstitutionen ein bzw. führen Programme und Bewährungshilfe durch.

Als Vollzugsinstitutionen nehmen die Gefängnisse Kanton Zürich, die Justizvollzugsanstalt Pöschwies und das Massnahmenzentrum Uitikon von den – auch ausserkantonalen – Vollzugs- und Strafverfolgungsbehörden eingewiesene Insassen auf.

Die wichtigsten Geschäftsfelder des Psychiatrisch-Psychologischen Dienstes (PPD) sind die Durchführung deliktpräventiver Therapieangebote und Risikoeinschätzungen mit Schwerpunkt Gewalt- und Sexualdelinquenz sowie die psychiatrische Grundversorgung aller Gefängnisse sowie Straf- und Massnahmenvollzugseinrichtungen im Kanton Zürich. Ausserdem führt der PPD anwendungsorientierte Evaluationsforschung im Amt für Justizvollzug durch und ist für die Qualitätssicherung zuständig.